MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 48681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015428	AAT	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015428	T	6	6	140	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015428	GTT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015428	AATT	2	8	320	327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015428	GCA	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700396
6	NC_015428	CACT	2	8	487	494	25 %	25 %	0 %	50 %	331700396
7	NC_015428	ATT	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700396
8	NC_015428	TAA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700396
9	NC_015428	GCCA	2	8	657	664	25 %	0 %	25 %	50 %	331700396
10	NC_015428	ATC	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
11	NC_015428	TAT	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700396
12	NC_015428	GCT	2	6	771	776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700396
13	NC_015428	GAA	2	6	789	794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
14	NC_015428	TGG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700396
15	NC_015428	ATC	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
16	NC_015428	TCA	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
17	NC_015428	GAA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
18	NC_015428	TCG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700396
19	NC_015428	TGA	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700396
20	NC_015428	AAG	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
21	NC_015428	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
22	NC_015428	TTC	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700396
23	NC_015428	CCG	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331700396
24	NC_015428	CGTG	2	8	1310	1317	0 %	25 %	50 %	25 %	331700396
25	NC_015428	GGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700396
26	NC_015428	ATC	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
27	NC_015428	AAGAA	2	10	1679	1688	80 %	0 %	20 %	0 %	331700396
28	NC_015428	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015428	TCTTT	2	10	1853	1862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015428	ATTA	2	8	1864	1871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015428	AT	3	6	1872	1877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015428	ACC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700397
33	NC_015428	GAT	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
34	NC_015428	GTTA	2	8	2102	2109	25 %	50 %	25 %	0 %	331700397
35	NC_015428	TGCC	2	8	2134	2141	0 %	25 %	25 %	50 %	331700397
36	NC_015428	TTC	2	6	2145	2150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700397
37	NC_015428	GAT	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
38	NC_015428	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700397
39	NC_015428	ACGA	2	8	2295	2302	50 %	0 %	25 %	25 %	331700397
40	NC_015428	ATT	2	6	2337	2342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700397
41	NC_015428	GTC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700397
42	NC_015428	GAT	2	6	2543	2548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
43	NC_015428	TGA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
44	NC_015428	GAA	2	6	2844	2849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700397
45	NC_015428	TCTGC	2	10	2964	2973	0 %	40 %	20 %	40 %	331700397
46	NC_015428	GACAGT	2	12	3000	3011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331700397
47	NC_015428	TTAA	2	8	3044	3051	50 %	50 %	0 %	0 %	331700397
48	NC_015428	CAA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015428	GTT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015428	T	7	7	3090	3096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015428	TTGC	2	8	3111	3118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015428	TTTC	2	8	3125	3132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015428	TGC	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015428	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015428	TCATT	2	10	3184	3193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015428	GGTG	2	8	3338	3345	0 %	25 %	75 %	0 %	331700398
57	NC_015428	A	6	6	3354	3359	100 %	0 %	0 %	0 %	331700398
58	NC_015428	AGA	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700398
59	NC_015428	ATT	2	6	3417	3422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700398
60	NC_015428	GGC	2	6	3429	3434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700398
61	NC_015428	AG	3	6	3453	3458	50 %	0 %	50 %	0 %	331700398
62	NC_015428	ACA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700398
63	NC_015428	T	6	6	3549	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	331700398
64	NC_015428	ATGA	2	8	3574	3581	50 %	25 %	25 %	0 %	331700398
65	NC_015428	TCTT	2	8	3657	3664	0 %	75 %	0 %	25 %	331700399
66	NC_015428	CAC	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
67	NC_015428	CGG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700399
68	NC_015428	CATGGA	2	12	3979	3990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331700399
69	NC_015428	CAC	2	6	4255	4260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
70	NC_015428	AGTCG	2	10	4285	4294	20 %	20 %	40 %	20 %	331700399
71	NC_015428	TGC	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700399
72	NC_015428	CCA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
73	NC_015428	TGA	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700399
74	NC_015428	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700399
75	NC_015428	CAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700399
76	NC_015428	TGA	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700399
77	NC_015428	TAT	2	6	4515	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700399
78	NC_015428	TGA	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700399
79	NC_015428	TTA	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700399
80	NC_015428	ACC	3	9	4604	4612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
81	NC_015428	CAG	2	6	4628	4633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700399
82	NC_015428	CGA	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
83	NC_015428	A	6	6	4733	4738	100 %	0 %	0 %	0 %	331700400
84	NC_015428	ATG	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
85	NC_015428	TCA	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
86	NC_015428	TGA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
87	NC_015428	CCA	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700400
88	NC_015428	TTACCG	2	12	4914	4925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	331700400
89	NC_015428	ACA	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700400
90	NC_015428	TGA	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
91	NC_015428	AGA	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700400
92	NC_015428	TTC	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700400
93	NC_015428	GGT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700400
94	NC_015428	GGC	3	9	5051	5059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700400
95	NC_015428	TGG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700400
96	NC_015428	GTT	2	6	5102	5107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
97	NC_015428	TAC	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
98	NC_015428	GTC	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700400
99	NC_015428	GAT	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
100	NC_015428	ACT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
101	NC_015428	TTG	2	6	5352	5357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
102	NC_015428	TTG	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
103	NC_015428	TAA	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700400
104	NC_015428	GAA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700400
105	NC_015428	ACG	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
106	NC_015428	TGT	2	6	5713	5718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
107	NC_015428	TGAC	2	8	5793	5800	25 %	25 %	25 %	25 %	331700400
108	NC_015428	TTG	2	6	5862	5867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
109	NC_015428	CAG	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
110	NC_015428	CCTG	2	8	5956	5963	0 %	25 %	25 %	50 %	331700400
111	NC_015428	TCG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700400
112	NC_015428	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700400
113	NC_015428	GAA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700400
114	NC_015428	ATT	2	6	6157	6162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700400
115	NC_015428	ATTA	2	8	6209	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	331700400
116	NC_015428	ATC	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
117	NC_015428	CCGATG	2	12	6237	6248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	331700400
118	NC_015428	TGT	2	6	6273	6278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
119	NC_015428	GAT	3	9	6392	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
120	NC_015428	TCC	2	6	6539	6544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331700400
121	NC_015428	TCT	2	6	6567	6572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700400
122	NC_015428	ACG	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
123	NC_015428	GCT	2	6	6657	6662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015428	TAA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015428	AAT	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015428	ATG	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
127	NC_015428	ATCT	2	8	6785	6792	25 %	50 %	0 %	25 %	331700401
128	NC_015428	A	7	7	6793	6799	100 %	0 %	0 %	0 %	331700401
129	NC_015428	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700401
130	NC_015428	TCG	2	6	6885	6890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
131	NC_015428	CCG	2	6	6998	7003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331700401
132	NC_015428	TGATGG	2	12	7086	7097	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	331700401
133	NC_015428	TGC	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
134	NC_015428	CAA	2	6	7164	7169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700401
135	NC_015428	ATG	2	6	7196	7201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
136	NC_015428	TCA	2	6	7319	7324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700401
137	NC_015428	TGA	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
138	NC_015428	CAG	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700401
139	NC_015428	CGG	2	6	7407	7412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700401
140	NC_015428	ATT	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700401
141	NC_015428	CGG	2	6	7506	7511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700401
142	NC_015428	CAA	2	6	7551	7556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700401
143	NC_015428	ATG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
144	NC_015428	TGAT	2	8	7658	7665	25 %	50 %	25 %	0 %	331700401
145	NC_015428	TCG	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
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147	NC_015428	TAT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700401
148	NC_015428	ACG	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700401
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150	NC_015428	CAAT	2	8	8079	8086	50 %	25 %	0 %	25 %	331700401
151	NC_015428	TGA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
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153	NC_015428	ATT	2	6	8160	8165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700401
154	NC_015428	ACG	2	6	8193	8198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700401
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157	NC_015428	GTG	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700401
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163	NC_015428	TCTTT	2	10	8589	8598	0 %	80 %	0 %	20 %	331700401
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167	NC_015428	TGC	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
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169	NC_015428	GCT	2	6	8926	8931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
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172	NC_015428	GGGC	2	8	9100	9107	0 %	0 %	75 %	25 %	331700401
173	NC_015428	GAT	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
174	NC_015428	CAAG	2	8	9226	9233	50 %	0 %	25 %	25 %	331700401
175	NC_015428	TGA	2	6	9234	9239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
176	NC_015428	TCAGAT	2	12	9265	9276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331700401
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178	NC_015428	ACTT	2	8	9400	9407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_015428	TGT	2	6	9473	9478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700402
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182	NC_015428	A	6	6	9508	9513	100 %	0 %	0 %	0 %	331700402
183	NC_015428	GAA	2	6	9540	9545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700402
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189	NC_015428	CTG	2	6	9859	9864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700402
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205	NC_015428	ATC	2	6	10595	10600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
206	NC_015428	ATG	2	6	10644	10649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_015428	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_015428	ATT	2	6	10746	10751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_015428	TTAA	2	8	10783	10790	50 %	50 %	0 %	0 %	331700403
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219	NC_015428	AAT	2	6	11204	11209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_015428	TA	3	6	11227	11232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_015428	TAT	2	6	11286	11291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_015428	AGG	2	6	11362	11367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
224	NC_015428	GAA	2	6	11379	11384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700404
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234	NC_015428	GAG	2	6	11691	11696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_015428	GTTC	2	8	11786	11793	0 %	50 %	25 %	25 %	331700405
236	NC_015428	TTG	2	6	11915	11920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700405
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242	NC_015428	CGG	2	6	12150	12155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700405
243	NC_015428	AAT	2	6	12157	12162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700405
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246	NC_015428	AAT	2	6	12202	12207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700405
247	NC_015428	GAT	3	9	12253	12261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700405
248	NC_015428	GTAAA	2	10	12281	12290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
249	NC_015428	GAG	2	6	12296	12301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015428	GGC	2	6	12328	12333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700406
251	NC_015428	GTC	4	12	12335	12346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700406
252	NC_015428	TGC	2	6	12363	12368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700406
253	NC_015428	TTC	2	6	12440	12445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700406
254	NC_015428	CGT	2	6	12448	12453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700406
255	NC_015428	TAA	2	6	12547	12552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700406
256	NC_015428	T	6	6	12585	12590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015428	TTG	2	6	12687	12692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700407
258	NC_015428	GAA	2	6	12765	12770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700407
259	NC_015428	CGC	2	6	12824	12829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331700407
260	NC_015428	AGT	2	6	12848	12853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700407
261	NC_015428	GGCCA	2	10	12900	12909	20 %	0 %	40 %	40 %	331700407
262	NC_015428	GAAA	2	8	12955	12962	75 %	0 %	25 %	0 %	331700407
263	NC_015428	ATT	2	6	13029	13034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700407
264	NC_015428	GTG	2	6	13049	13054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700407
265	NC_015428	ACC	2	6	13092	13097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700407
266	NC_015428	CAT	2	6	13134	13139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700407
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497	NC_015428	CAA	2	6	23198	23203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700414
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